显微镜摄像头是一种专门用于和显微镜结合来获取显微镜成像图像的光学仪器，其原理大致为：检测样品通过镜头生成的光学图像投射到图像传感器表面上，然后转为电信号，经过A/D转换后变为数字图像信号，再送到数字信号处理芯片(DSP)中加工处理，再通过USB接口传输到电脑中处理，通过显示器直接观察图像，保存图像数据等。
显微镜相机的集成提供了符合人体工程学的工作环境，可以直接在屏幕上观察样品图像。保护细胞免受不必要的光，捕捉微弱的荧光信号，为用户实现多色成像。显微镜摄像头的研发成功解决了广大研究者的苦恼问题，通过显微镜摄像头抓取到每次观察的样品图像，这样就能很好的保存D一手的原始数据，不仅可以作为实验的数据进行对比，还能**的保存下来作为一份有价值的参考数据。
目前，显微镜摄像头可应用领域在工业、农业、生物、医疗领域均有很重要的作用，主要用来配套生物显微镜、荧光显微镜、金相显微镜、偏光显微镜、体视显微镜、扫描设备、监控设备等仪器使用。
农业领域上，配合专业的光学设备用来使用；研究动植物、微生物、昆虫等不同组织和微小器官的表面形态及内部结构，对于观测大景深的物体需要景深扩展功能，较大的物体具有图像拼接功能。
生物领域上，显微镜摄像头可用来很好的对进行观测和分析，用于弱光或荧光图像的拍摄与分析，用于病理分析等对色彩要求高的领域。
显微镜摄像头的选购、显微镜成像软件的好坏往往会影响到整个系统的成像效果。因为在选择显微镜成像软件时，需要根据不同的领域，不同的使用环境，选择合适的相机软件来配合摄像头的使用。
